A administração rodoviária conta com cinco áreas operacionais:
Planeamento e Desenvolvimento: Responsável pelo planeamento estratégico e operacional dos empreendimentos, pelo desenvolvimento dos programas de investigação, normas e especificações técnicas na área das infraestruturas rodoviárias, pelo sistema de monitorização e recenseamento de tráfego e pela coordenação das atividades relacionadas com os organismos internacionais do sector rodoviário.
Projetos e Empreendimentos: Tem por objetivo primordial a execução e colocação ao serviço público de novos lanços de estrada da Rede Rodoviária Nacional incluídos no Plano de Investimentos, sendo responsável por todas as atividades relacionadas com a realização física da estrada, desde o planeamento até à abertura dos novos empreendimentos à circulação rodoviária.
Conservação, Exploração e Segurança Rodoviária: Cabe a esta área a responsabilidade pelas atividades relacionadas com a manutenção e exploração da rede, desde a inspeção e planeamento das intervenções de conservação e reabilitação até às actividades ligadas à segurança rodoviária, comunicação e assistência aos utentes.
Concessões: Responsável pelas atividades inerentes ao exercício de poderes de concedente do Estado, designadamente de apoio técnico ao lançamento dos concursos de concessões, ao acompanhamento e apoio das comissões de avaliação dos concursos, à regulação e gestão dos diferentes contratos de concessão e ao acompanhamento das condições de exploração das redes de autoestradas e áreas de serviço concessionadas.
Obras de Arte e Estruturas Especiais: Cabe a esta área a responsabilidade pelas atividades essenciais à definição e estudo do sistema de pontes, obras de arte e estruturas especiais, assim como organizar o lançamento dos projetos, sua construção e respetivo controlo de qualidade. Na fase pós-construção, é responsável pela definição e gestão do sistema das inspeções às obras de arte, assim como pela coordenação das intervenções de conservação, reabilitação ou grande manutenção